基层医疗综合管理系统是在国家要求的村卫生室业务信息系统的基础上，结合河南省实际情况，梳理乡级卫生机构的业务需求，以乡村卫生一体化管理为目标研发而成的信息系统。涵盖医疗服务、公共卫生、医疗保障、药品监管四类业务体系。　　　　　　　　　　　　　　

系统应用主要分为三部分：

客户端：基本诊疗服务、新农合门诊统筹、基本公共卫生服务、药品管理、乡村医生培训、统计报表。

中心端：信息发布、注册服务、统计分析、绩效考核、系统管理。

外部系统接口：乡镇卫生院系统、区域卫生信息平台、新农合平台、公共卫生、妇幼保健等。